國家旅游局、公安部、國務院臺灣事務辦公室2006年4月16日聯合發布 《大陸居民赴臺灣地區旅游管理辦法》。全文如下：
    第一條　為規范大陸居民赴臺灣地區旅游，依據《中國公民往來臺灣地區管理辦法》和《旅行社管理條例》，特制定本辦法。

    第二條　大陸居民赴臺灣地區旅游（以下簡稱赴臺旅游），須由指定經營大陸居民赴臺旅游業務的旅行社（以下簡稱組團社）組織，以團隊形式整團往返。參游人員在臺灣期間須集體活動。

    第三條　組團社由國家旅游局會同有關部門，從已批準的特許經營出境旅游業務的旅行社范圍內指定，由海峽兩岸旅游交流協會公布。除被指定的組團社外，任何單位和個人不得經營大陸居民赴臺旅游業務。

    第四條　臺灣地區接待大陸居民赴臺旅游的旅行社（以下簡稱接待社），經大陸有關部門會同國家旅游局確認后，由海峽兩岸旅游交流協會公布。

    第五條　大陸居民赴臺旅游實行配額管理。配額由國家旅游局會同有關部門確認后，下達給組團社。

    第六條　組團社在開展組織大陸居民赴臺旅游業務前，須與接待社簽訂合同、建立合作關系。

    第七條　組團社須為每個團隊選派領隊。領隊經培訓、考核合格后，由地方旅游局向國家旅游局申領赴臺旅游領隊證。組團社須要求接待社派人全程陪同。

    第八條　組團社須要求接待社不得引導和組織參游人員參與涉及賭博、色情、毒品等內容的活動。

    第九條　組團社須要求接待社嚴格按照合同規定的團隊日程安排活動；未經雙方旅行社及參游人員同意，不得變更日程。

    第十條　大陸居民須持有效《大陸居民往來臺灣通行證》（以下簡稱《通行證》）及旅游簽注（簽注字頭為Ｌ，以下簡稱簽注）赴臺旅游。

    第十一條　大陸居民赴臺旅游須向指定的組團社報名，并向其戶口所在地公安機關出入境管理部門申請辦理《通行證》及簽注。

    第十二條　赴臺旅游團須憑《大陸居民赴臺灣地區旅游團名單表》，從大陸對外開放口岸整團出入境。

    第十三條　旅游團出境前已確定分團入境大陸的，組團社應事先向有關出入境邊防檢查總站或省級公安邊防部門備案。

    旅游團成員因緊急情況不能隨團入境大陸或不能按期返回大陸的，組團社應及時向有關出入境邊防檢查總站或省級公安邊防部門報告。

    第十四條　參游人員應按期返回，不得非法滯留。當發生參游人員非法滯留時，組團社須及時向公安機關及旅游行政主管部門報告，并協助做好有關滯留者的遣返和審查工作。

    第十五條　違反本辦法之規定的旅行社，旅游行政主管部門將根據《旅行社管理條例》予以處罰。對組團單位和參游人員違反國家其他有關法律、法規的，由有關部門依法予以處理。

    第十六條　本辦法由國家旅游局、公安部、國務院臺灣事務辦公室負責解釋。

    第十七條　本辦法自發布之日起施行。