根據生態系統的整體性而確定的"環保大部制"改革正在穩步推進。根據這一框架，環保部將實行獨立而統一的環境監管，建立起陸海統籌的生態系統保護修復和污染防治區域聯動機制。按照這一思路，國土資源部、林業局、水利部、海洋局等相關部門中與環境保護相關的職能，有可能并入環保部。

環境保護部官網2月11日刊發的環保部部長周生賢的講話稱，"環保部將實行獨立而統一的環境監管，健全'統一監管、分工負責'和'國家監察、地方監管、單位負責'的監管體系。"在談到改革生態環境保護管理體制時，周生賢表示，生態系統的整體性決定了生態保護修復和污染防治必須打破區域界限，統籌陸地與海洋保護，把海洋環境保護與陸源污染防治結合起來。這是作為環保部部長的周生賢，第二次公開談及國家海洋局職責范圍內的海洋生態系統保護問題，以及國家林業局職責范圍內的林業生態系統保護問題。

去年11月，在中國環境與發展國際合作委員會(下稱"國合會")2013年年會上，周生賢說，當前推進生態環境保護管理體制改革有五個重點，包括建立統一監管所有污染物排放的環境保護管理制度，獨立進行環境監管和行政執法；建立陸海統籌的生態系統保護修復和污染防治區域聯動機制等。

目前，我國的環保職能分割為三大方面：污染防治職能分散在海洋、港務監督、漁政、漁業監督、軍隊環保、公安、交通、鐵道、民航等部門;資源保護職能分散在礦產、林業、農業、水利等部門；綜合(行情 專區)調控管理職能分散在發改委、財政、經貿(工信)、國土等部門。